Andrea Pestalozza fonda la casa editrice Ape nel 1999, con l'obiettivo di specializzarsi in libri per l'età prescolare e in albi illustrati. Di Ape Junior è Kirikù e la strega Karabà, da cui è stato tratto l'omonimo film.
Da segnalare la collana "Piccoli Filosofi" del 2002 e "ZigZag", collana di narrativa inaugurata l'anno successivo. Nel 2005 Ape Junior viene acquisita da Adriano Salani Editore: abbandonate le collane di narrativa, il catalogo si concentra sempre di più sulla fascia pre-scolare, arricchendo il settore dei cartonati e degli albi illustrati. Due anni dopo l'acquisizione la casa editrice inaugura le prime collane interamente concepite in Italia, che affiancano la tradizionale produzione di autori ed illustratori stranieri.
Il catalogo Ape Junior annovera tra i suoi autori, tra gli altri, Lodovica Cima, Elena Giorgio e Lauren Child.