Ran e Conan giungono come ospiti nella villa di montagna di una compagna di scuola della ragazza. A causa di un raccapricciante omicidio, però, quello che avrebbe dovuto essere un tranquillo soggiorno montano si trasforma ben presto in un incubo. Sarà poi la volta di un caso che riguarda la morte di un famoso cantante durante un'esibizione al karaoke. Tutto sembrerebbe far pensare a un suicidio per avvelenamento, ma qualcosa non torna. Per risolvere il mistero, Conan dovrà indagare nel passato della vittima e svelare il vero volto di una tragica storia d'amore...

Shinichi Kudo è un giovane e talentuoso detective. Il giorno in cui sorprende una banda di loschi criminali vestiti di nero, comincia per lui una nuova era... Costretto da uno di loro a ingoiare una pillola letale, il ragazzo riesce miracolosamente a sopravvivere ma si ritrova di punto in bianco "rimpicciolito": la pillola ha infatti indotto le sue cellule ad autoridursi, facendolo tornare un bambino di sette anni, ma lasciando il suo cervello inalterato! Così il mini-investigatore, determinato a dare la caccia alla misteriosa organizzazione degli "uomini in nero", assume l'identità di Conan Edogawa...