Luyendijk ha studiato in Kansas, Amsterdam, e Il Cairo, dove si è laureato. In seguito ha fatto da corrispondente per diverse associazioni olandesi nel medio Oriente, in particolare Egitto, Libanoe Palestina. In Iraq ha partecipato come reporter durante la Seconda Guerra del Golfo. Dal 2010 occupa la Leonardo Chair all'Università di Tilburg, dove insegna Giornalismo. Dal 2011 invece si trova a Londra, dove lavora per il «Guardian».
Tra i suoi libri pubblicati in Italia ci sono Gente come noi. Realtà e pregiudizio in Medio Oriente (Il Saggiatore 2008) e Nuotare con gli squali. Il mio viaggio nel mondo dei banchieri (Einaudi 2016).