Dopo essersi diplomato in arte a Philadeplhia, ha vissuto a Toronto, dove è rimasto (illegalmente) dal 1988 al 2002. Nel 1987 ha cominciato a tenere un “diario a fumetti”, pubblicato nel 1992 dalla Kitchen Sink Press col titolo di Peepshow: the Cartoon Diary of Joe Matt. Il volume Poor Bastard, pubblicato da Drawn & Quarterly (e in Italia da Coconino), include i primi sei numeri della seconda serie di Peepshow. Sempre Drawn & Quarterly ha pubblicato i graphic novel Fair Weather (Il bel tempo - Coconino 2011) e Spent.