Accusati di un gravissimo attentato al Cremlino, l'agente Hunt e la sua squadra vengono messi al bando e arrestati dal governo degli Stati Uniti. Ma, grazie ad un aiuto dall'interno, riescono a fuggire e, appoggiati dal Presidente, mettono in atto l'operazione "Protocollo Fantasma". Senza copertura e senza nessun aiuto dovranno dimostrare la loro innocenza, sventare un attacco nucleare e fermare quella che potrebbe diventare la Terza guerra mondiale.)