EM Publishers ha raccolto e realizzato il progetto Encyclomedia ideato e diretto da Umberto Eco per una completa storia della civiltà e della cultura europea dalle origini ai giorni nostri, scritta in collaborazione con 400 autorevoli specialisti di diverse discipline quali storia, filosofia, arti visive, scienza e tecnologia, musica, letteratura, teatro e comunicazione.
Il progetto editoriale si articola in collane di saggistica organizzate per periodi storici, in collane di ebook, in saggi universitari e in libri scolastici. Correda e completa il progetto il sito web Encyclomedia Online, che è stato presentata all'ONU nell'ottobre 2013 come l'opera più significativa per la conservazione della memoria storica.